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Dès le début de ses recherches, Freud a voulu donner un soubassement théorique et scientifique approfondi aux notions et hypothèses psychologiques qu'il élaborait. Le terme métapsychologie (1) est apparu pour la première fois dans la lettre 41 du 13 février 1896. Freud confie à Fliess tout son intérêt pour la lecture de Taine, dont il se sent fort proche: “La psychologie - ou plutôt la métapsychologie - me préoccupe sans cesse” (Lettre 41). Quelques semaines plus tard il ajoutera: “Je n'ai aspiré dans mes années de jeunesse qu'aux connaissances philosophiques et maintenant je suis sur le point de réaliser ce voeu en passant de la médecine à la psychologie” (Lettre 44 du 2.4. 1896).
Il est important pour comprendre la pensée de Freud dans cette période de connaître la façon dont elle s'ancre dans les courants de pensée de son époque.
L'influence de Brûcke, son premier grand maître à l'Institut de Physiologie, a été décisive dans l'élaboration chez Freud d'un système de pensée scientifique à l'égard de l'organisme vivant. Brûcke était le représentant à Vienne de l'Ecole de Helmholtz, fondée sur l'application d'un déterminisme rigoureux à la biologie et à la psychophysiologie, et à laquelle s'était rattachée l'Ecole de Fechner qui le premier a essayé d'appliquer à la neurologie et à la psychologie le principe récemment découvert de “conservation de l'énergie”.
Avec Meynert, son premier maître en psychiatrie, anatomiste du cerveau, Freud va entrer en contact avec la psychologie d'Herbert dont il va transposer à la psychopathologie certains concepts, ceux de conflit psychique, d'inconscient dynamique, la recherche d'équilibre comme principe de la vie psychique entre autres. Inconscient dont parle par ailleurs Hartmann qui publie en 1868 une Philosophie de l'Inconscient rapidement traduite en français et en anglais.
Il faut encore souligner l'influence de Brentano sur Freud. Celui-ci enseigne une philosophie fondée sur l'intentionnalité, c'est-à-dire une attitude intérieure d