Au contraire de la différence anatomique entre les sexes, le genre est une notion hautement subjective. Il est facile de distinguer un homme d'une femme, mais la question de la féminité et de la masculinité est une distinction plus qualitative et davantage une question psychologique, et d'une certaine façon culturelle. La question du genre dans l'établissement d'une analyse est principalement une question de contre-transfert. Les fondements de l'identité du psychanalyste sont liés à la question du genre et certains patients souffrant de difficultés de genre peuvent menacer son identité. Il faut espérer que celui-ci soit capable de jouer avec le genre projeté sur sa personne par le patient. La réaction contre-transférentielle de genre immédiate de l'analyste est de beaucoup le mouvement le plus important dans l'établissement de l'analyse.